重庆府即古之巴郡，因大江与嘉陵江自朝天门合流三折而呈“巴”字得名。南朝梁武陵王萧纪于此置楚州，后至隋朝改为渝州。北宋崇宁年间，因奉议郎赵谂在此被人告发谋反，宋徽宗赵佶易名渝州为恭州，以恭顺警之。南宋淳熙十六年宋孝宗赵眘驾崩，分封于此的恭王赵惇得继大统，遂改名重庆并沿用至今。
府城建于两江交会处的石山之上，左右峭壁夹峙，东、南、北三面皆为江水环绕，成为天然的护城河。三国时蜀汉中都护李严还曾打算将佛图关以下的山脊从腰部截断，让大江与嘉陵江水流相通从而使重庆府城彻底变为四面环江的岛城，但最终被益州牧诸葛亮以动损地脉为由制止了。从这里亦可见重庆府城天然地利之好。
城周十二里六分，形状似乌龟翘尾，城垣高达十丈，有大小城门十七座，九开八闭，取“九宫八卦”象征意思。本朝洪武年间，在旧城遗址上改建并修砌石城，更为坚固。
除了府城本身，周遭形胜同样险峻。从府城溯大江而上八十里有猫儿峡，石壁高耸穿云，陡峭堪比夔门。沿江而下二十里有铜锣峡，壁立千仞不亚于猫儿峡。此二峡即重庆府水路上下门户。另有城西佛图关，仅山脊峭壁间开凿出的一线小道与城相通，为路上咽喉。佛图关向西更有二郎关，万仞深壑，一门壁辟，又乃佛图关的锁钥。
综观府城周围，可谓一关叠一关、一峡接一峡，居高临深，险扼天城。
张献忠此前几度入川，都避重庆府城而走，便是担心一旦作战，就将受关峡钳制，难以脱身。但同时，他也搜罗到了许多有关信息情报，可以说对重庆府城及其周边防务了如指掌。西军一反常态，久驻涪州厉兵秣马，很显然是在为攻取重庆府城积蓄力量。
四川巡抚陈士奇心里很清楚，川中兵力不比往昔，张献忠这次进犯，绝不会甘心似向年那样简单游荡在川东游击劫掠，所图必大。然而要想打通前往四川腹地的孔道，重庆府就是张献忠不得不面对的障碍。换言之，对陈士奇来说，只要保住重庆府，最坏的结果顶多川东被打个稀烂。可重庆府若失，那整个四川的形势就再难掌握。
作为赵营经略四川的两名主要统帅，王来兴与覃奇功的大方针即是赵当世惯用的“驱虎吞狼”。四川局势混乱，他们的首要任务就是再添一把火，把四川这一锅粥煮得越沸越好。水至清则无鱼，混水之中才好摸鱼取利。
九月中旬，击败了川兵野战部队的西军继续沿江进军，不久后攻占长寿县，进抵铜锣峡东面。与此同时，赵营兵马到达忠州。按照原定计划，军队稍作休整不日将紧随西军之后去往酆都县，于是王来兴趁着在忠州短暂的休整时间，一方面请随军的统权使司副使郑时齐轻骑赶赴临近的石砫宣慰司请兵，一方面则聚起几个核心成员临时开了个秘密小会。参加临时会议的人除了王来兴、覃奇功，另外只有提军邓龙野、提领孙为政、统制王光英三人而已。
“川抚衙门兵力捉襟见肘，陈士奇保地守土要紧，有我军相助，必然不会拒绝。”日前赵‘荣贵已经请覃奇功代笔写了信星夜兼程送去重庆府城，覃奇功猜测起陈士奇的态度自信十足，“有我军帮他灭贼，他乌纱帽或许还能保住。”
“他在四川本来就是空架子，多一支我军又何妨。”王来兴笑了笑，“我猜等灭了献贼，他保不齐还要主动请咱们帮他收拾其他刺头呢。”
覃奇功微笑道：“是有这个可能。”转而正色，“不过这都是后话，川中糜烂，以至于献贼能横行无忌。献贼一灭，咱们拥陈士奇自雄，川事可定。”这便是他一早定下来的主要方略，现在看来，实现指日可待。
“川兵林林总总虽也有不少，但一来大多战力低下，二来分散无序，我军本部加谭家兄弟、赵‘荣贵已有一万五千人，谅川地无人能是对手。”王来兴说道。
“以势压人，是自古常行的手段。我等控制住了陈士奇，借他名义整合川中更是名正言顺。”覃奇功抚须而言，“说来说去，当务之急还是得将献贼及早灭了。”
川兵的羸弱令人意外，西军壮大之速同样出人意料。覃奇功继续道：“献贼入川，如鱼得水，几乎有当年闯军复起于河南的燎原之势，如果不尽早扼杀，必成大患。”
王来兴点头道：“正是，而今献贼不自量力，攻打重庆府城自投罗网，此就是将之歼灭的最好的机会。要是老郑这一趟顺利能劝来些石砫兵马相助，我军胜算更大。”
“不知当下豫事如何了？”王光英忽然插问一句，他记得赵当世说过，等豫事尘埃落定，或许将抽兵增援川中。
“陕兵与闯军仍在相持。”覃奇功一直与湖广方面保持着密切的书信联系，“胜负还很难说。主公要我等众心一致办好川事，等豫事有了结果，自有计议。”
众人点头称是，王来兴突然咧嘴一笑，故意打趣道：“主公不是屡屡提醒咱们要居安思危吗？各位说，要是张献忠如有神助，真的拿下了重庆府，我军如何应对？”说完，自己先哈哈笑了起来。
覃奇功摇头道：“重庆府城地势、修工皆甲于天下，非寻常州县可比。献贼虽然发展迅速，但还远远比不上闯军。以闯军之强橫，在开封府城都能困顿那么久，献贼要拿下比开封更险更坚固的重庆府或许真像王总管所言，要有天神相助方可。”
“希望天佑我军，而非助纣为虐。”邓龙野、孙为政及王光英皆道。
谁知数日后，王来兴那句无心的玩笑话，竟然一语成谶。
先是有好消息传来。石砫宣慰司的实际当家秦良玉本就深怀忠君爱国之心，去往石砫宣慰司的郑时齐抓住这点，晓以大义。秦良玉与族内骨干商议一番，还是决定抽出二千兵马助战。但有个前提，便是事毕即回，即平定了张献忠就回石砫。
这支石砫兵由秦良玉长孙、目前石砫宣慰司宣慰使马万年带领。马万年刚二十出头年纪，没打过什么仗，川东土司遍地，相互仇杀争斗，秦良玉对他寄予厚望，自有给他机会磨砺锻炼的意思在里面。另外随军的还有秦良玉的两个侄子秦拱明、秦祚明为辅佐。秦拱明之父秦邦屏在泰昌元年战死于辽东浑河，秦祚明之父秦民屏也在天启四年的奢安之乱中陷阵死，两人都是忠烈之后，任职过参将、副将等军职，熟知行伍，有他们在，石砫兵的战斗力依然有保证。
会合了石砫兵后，赵营本部即附庸兵马一万七千人随之挺进酆都县。没成想，九月下旬，就在王来兴巡视外县城内外防务回到城中时，覃奇功早已等候在了那里，且从覃奇功那愁云密布的脸上，王来兴心知事有不妙。
“府城已经陷于贼手。”覃奇功说完短短八个字，直似说完千言万语，长长吁了口气。
“怎么会......”王来兴如遭雷劈，呆立原地。
原来六日前，抵达铜锣峡的西军以马元利为前部，先攻了一次，结果为驻守的川兵挡了回去。张献忠与众将商议后认为强攻不可行，即便强攻拿下铜锣峡，代价必大，且铜锣峡之后，重庆府城外围据点无数，把大批兵力消耗在这些地方最后也未必能有余力接着攻克重庆坚城。此外，西军已经注意到尾随其后的赵营兵马，所以主要几名军将们意见一致，觉得必须速战速决，不能给官军前后夹击的机会。
张献忠做事从来果断，他令马元利率军继续佯攻铜锣峡吸引住川兵的注意，自己则带着精骑营精锐在后方择窄湾强渡至大江南岸，之后再度利用最拿手的奔袭，从南岸大兴场一昼夜疾驰一百五十里，绕到重庆府上游的江津县，在那里迅速击溃毫无准备的少量川兵，夺取了船队。然后马不停蹄，兵分两路，一路王尚礼指挥马军重新渡至江北，并沿德感坝转进重庆府西面官修大道，至佛图关前附近待命。另一路张献忠亲自指挥，乘船自江津顺流直下偷过猫儿峡，只经过大半日时间即登陆重庆府城与佛图关之间的菜园口，继而抄至两路口，截断了两边官军的联系。
佛图关川兵腹背受敌，仓皇失措，向重庆府城撤退，张献忠趁机与王尚礼合力取下佛图关。佛图关位于铜锣峡上游，一旦易手，铜锣峡也不免进退失据。马元利借势再攻，很快破口。张献忠、王尚礼、马元利三路碰头，大军由是顺利齐聚重庆府城之下。
重庆府城虽说坚固异常，但短时间内精心布置的外围防线即宣告瓦解使得城内川兵们极为震骇。有不少军将甚至假意提议出城背水一战，暗中考虑见机逃命。陈士奇看出他们的鬼心思，严令禁止，让标下副将卞显爵为主，主守通远门，意欲凭城力却西军。
张献忠在几番劝降未果后开始攻城，首攻南纪门。可是重庆府城到底难攻，南纪门城墙极高，城基更全是岩石，难以利用放崩法挖地道爆破，马元利、王尚礼分别指挥架云梯蚁附攻了几轮。城内物资极多，守城器械应有尽有，川兵全力应战，倾泻火石、滚木、沸油等等源源不断，西军一时难以接近。
张献忠对重庆府城志在必得，即便受挫也不丧气。在夜间亲自骑马绕着府城城墙周密侦察，结果在通远门城根部发现有土，可以挖掘地道。次日清晨，立令兵士行动。川兵一如既往阻击西军，但张献忠威势甚烈，下了死命令，无人敢再退后半步，无数西军兵士顶着木板，前仆后继靠近通远门附近的墙根，短短一日，死尸堆满城下，如同座座山茔。连挖两日，是日黑云密布，地道已成，但缺乏炸药容物。张献忠别出心裁，令兵士就近砍伐大圆木，凿空中心，填入千斤火药，外用铁皮包裹严实，凑出一共数十根抬进城根下的地道。至夜间火发炮着，爆炸震响如同地裂山崩，城内外烈焰四起。
西军兵士清晨全力进攻，守在通远门的卞显爵犹不退缩，砥砺奋战，然而早就松动的通远门城楼上下在此时轰然倒塌，卞显爵被压死在崩毁的角楼废墟里，川兵大溃。西军杀入城中，四川巡抚陈士奇、重庆知府王行俭、巴县知县王锡、重庆卫指挥顾景等被西军一网打尽。张献忠志得意满，押着这些官员跪在衙署里，历数其罪状，一一处死。
真正算起来，张献忠从开始攻打铜锣峡到最后攻克重庆府城，仅用了六日。
也难怪王来兴听到此讯时瞠目结舌，不敢置信。
“献贼狡诈，恐怕是听闻了闯军在河南的做派，效仿着派人四处宣扬‘但能杀官宦乡绅，封府库以待天兵，皆秋毫无犯’云云，真把自己当正义之师了。”覃奇功嘴角微笑苦涩，“倒也真有愚民愚官信其谬言，江津、璧山等县的官员畏之如虎，听说好些都望风送款，求保平安。”
“世事难料，世事哪料......”刚下马的王来兴木然连说两句，猛然踩蹬复上马背，急急招呼道，“覃先生，时不我待，咱们来不及了，赶紧召集众将往县衙一会！”
却不料覃奇功快走两步上来，伸手拉住他手道：“总管且慢，我这里非止重庆府一事，还有件大事要报给你知道。”
“什么事？”王来兴没来由心中咯噔一响。
“河南的仗打完了。”