“陛下多想了，秦王让我来是担心陛下受惊，特让我护卫陛下，待秦王平定叛乱自会亲来见驾，”尉迟恭说完站在船边守卫，不在说话。
李渊作为帝王，心智当然不一般，此刻定了定神道：“裴监，现在如何是好？”
“陛下，现在事已成定局，不如顺水推舟......”裴寂的意思很明显，太子和齐王已死，唯有秦王李世民可以继承皇位，不如做个顺水人情也可保得身家性命。
“陛下，臣以为太子和齐王本来就没有参与举义兵反抗隋朝的谋略，又没有为天下立下功劳。他们嫉妒秦王功劳大，威望高，便一起策划奸邪的阴谋。现在，秦王已经声讨并诛杀了他们，秦王功盖宇宙，天下归心，陛下如果能够决定立他为太子，将国家大事委托于他，就不会再生事端了。”旁边萧瑀义正言辞的说道。
陈叔达：“臣附议。”
余下几人：“臣等亦附议。”
李渊冷冷的看着几人，突然有种众叛亲离的感觉，心中落寞，好像苍老了几分：“众卿既然都如此认为我也就放心啦，这本来就是我的心愿啊。”说完咳嗽了几声，脸色愈见苍白。
尉迟恭闻言大喜，闻听玄武门战事还未平息，恐有变故便对李渊道：“陛下，此时各兵营必是人心惶惶，还请陛下颁布敕令，各军兵马全听秦王处置。”
李渊看大事已定便道：“好，就如尉迟将军所言，也免得我大唐将士徒增伤亡，来人，上笔墨。”
李渊飞快下笔，完全没有了平时的洋洋洒洒，写完吩咐道：“宇文士及，你去东上阁宣布敕令，裴监就劳烦你去东宫安抚众人吧，记得还请照料一下我的孙儿。”说完重重的靠在靠背上。
尉迟恭见事已定，急急忙忙往玄武门赶，此时战事还未停息，必是出了变故，顺手取了太子和齐王的首级直奔玄武门。
玄武门前，宿卫军士气低落，中郎将吕世衡也已战死，东宫侍卫慢慢占了上风，薛万彻看玄武门久攻不下，亲自擂鼓，集结兵力进攻秦王府。城上众人大惊，秦王府一破必遭屠戮，自己也脱不了关系。
尉迟恭快马赶来，急急赶上城楼，眼看东宫侍卫就要冲击秦王府。尉迟恭大吼一声：“太子和齐王已经伏诛，首级在此还不快快束手......”
一连喊了三遍，城下众人一阵大惊，东宫精锐攻势一缓，待看清尉迟恭手中之物，顿时士气全无，迅速崩溃。
薛万彻看着太子首级，眼泪狂涌而出，看东宫精锐已经溃败，大势已去，带领亲卫朝终南山疾驰而去。
冯立暗叹一口气对部下说：“我等杀了敬君弘这也算是略微报答一下太子了。”随后兵器一丢，落荒而逃。
东宫府前，长孙无忌领兵直接往里闯，东宫侍卫奋起反抗，可是无奈人数不多，被尽数杀死，长孙无忌向众军士一挥手，众将士冲杀进去，不时东宫中传出了妇孺孩童的惊呼声和惨叫声，长孙无忌冷冷一笑，带兵前往齐王府......
海池中李世民应召而来，李渊看着站在自己面前的二子，心中百感交集，强打起精神，露出一抹难看的笑容：“世民，这些日子以来你我之间产生了隔阂，差点让我不再信任你了，如今太子和齐王叛乱，还是你来救驾，看来你是我最信任的儿子。”
李世民眼睛一红扑到李渊怀中嚎啕大哭，良久才起身劝道：“父皇受此惊吓必已劳累，还是回寝宫休息吧。”
李渊叹口气点点头道：“好，我儿莫要太过劳累。”说完由内侍扶起，一步一步向甘露殿走去，脚步异常萧索。
李世民擦干泪水，眼中精光闪闪，头也不回的问道：“无忌都处理好了吗？”
“启禀殿下，都已处理好了，宫内也已平静。”
“嗯，回府。”
至此玄武门已落下帷幕。
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夜幕降临，太极宫甘露殿中，李渊坐在龙案后望着殿下的裴寂，良久问道：“裴监，我那孙儿可好？”
“这...老臣赶到东宫时...东宫已经无人...小殿下们已经...已经...”裴寂不知如何去说，又恐老友气急，在此敏感时期出了问题，自己可吃罪不起啊。
“好了，裴监，你先退下吧。”李渊语气很平静，平静的可怕。
裴寂退下后，李渊身子突然一震张口吐出一口血来，昏死过去...
第二日，李渊未能早朝，宣布一道圣旨：从今天起，秦王李世民去秦王衔，封为皇太子，军队和国家的各项事务，无论大小，全部委托太子处理和决定，然后再报告给朕。
至此李世民成为皇太子，在朝廷上下安插亲信，李世民还将王圭和韦挺从巂州（治所在今四川西昌）召回，两人和原太子冼马魏徵一起都担任了谏议大夫。任命政变功臣屈突通为陕东道行台左仆射，镇守洛阳。
以秦王府护军秦琼为左卫大将军，又以程知节为右武卫大将军，尉迟恭为右武候大将军。高士廉为侍中，房玄龄为中书令，萧瑀为左仆射，长孙无忌为吏部尚书，杜如晦为兵部尚书。宇文士及为中书令，封德彝为右仆射；天策府兵曹参军杜淹为御史大夫，前任中书舍人颜师古、刘林甫为中书侍郎，左卫副率侯君集为左卫将军，左虞候段志为骁卫将军，原东宫副护军薛万彻为右领军将军，右内副率张公谨为右武候将军，右监门率长孙安业为右监门将军，右内副率李客师为领左右军将军。至此，李世民麾下成员和支持李世民的官员控制了大唐的要害部门和职位，完全掌握了大唐上下的军政大权。
并发下敕令，赦免了原太子李建成和齐王麾下的余党，派遣谏议大夫魏徵安抚崤山以东地区，允许他见机行事。
武德九年八月九日，李渊宣布禅位，李世民推辞不过，尊李渊为太上皇，在甘露殿中颐养天年，李世民宣布登基，号贞观，下一年的正月一日为贞观元年。